prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

2020

• An Ultrasensitive Fluorescence Assay for the Detection of Halides and Enzymatic Dehalogenation

  ASLAN-UZEL Askin S. BEIER Andy KOVÁŘ David CZIEGLER Clemens PADHI Santosh K. SCHUITEN Eva D. DORR Mark BOTTCHER Dominique HOLLMANN Frank RUDROFF Florian MIHOVILOVIC Marko D. BURYŠKA Tomáš DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk BADENHORST Christoffel P. S. BORNSCHEUER Uwe T.

  Článek v odborném periodiku

  ChemCatChem, rok: 2020, ročník: 12, vydání: 7, DOI

• CaverDock: A Novel Method for the Fast Analysis of Ligand Transport

  FILIPOVIČ Jiří VÁVRA Ondřej PLHÁK Jan BEDNÁŘ David MARQUES Sérgio Manuel BREZOVSKÝ Jan MATYSKA Luděk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, rok: 2020, ročník: 17, vydání: 5, DOI

• Decoding the intricate network of molecular interactions of a hyperstable engineered biocatalyst

  MARKOVÁ Klára CHMELOVÁ Klaudia MARQUES Sérgio Manuel CARPENTIER Philippe BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Chemical Science, rok: 2020, ročník: 11, vydání: 41, DOI

• DockVis: Visual Analysis of Molecular Docking Trajectories

  FURMANOVÁ Katarína VÁVRA Ondřej KOZLÍKOVÁ Barbora DAMBORSKÝ Jiří VONÁSEK Vojtěch BEDNÁŘ David BYŠKA Jan

  Článek v odborném periodiku

  Computer Graphics Forum, rok: 2020, ročník: 39, vydání: 6, DOI

• EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities

  HON Jiří BORKO Simeon ŠTOURAČ Jan PROKOP Zbyněk ZENDULKA Jaroslav BEDNÁŘ David MARTINEK Tomas DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2020, ročník: 48, vydání: W1, DOI

• Exploration of enzyme diversity: High-throughput techniques for protein production and microscale biochemical characterization

  VAŠINA Michal VAŇÁČEK Pavel DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Kapitola v knize

  Methods in Enzymology - Enzyme Engineering and Evolution: General Methods, rok: 2020, počet stran: 35 s.

• Fluorescent substrates for haloalkane dehalogenases: Novel probes for mechanistic studies and protein labeling

  DOČKALOVÁ Veronika MARQUEZ SANCHEZ - CARNERERO Esther Maria DUNAJOVÁ Zuzana PALAO UTIEL Eduardo SLÁNSKÁ Michaela BURYŠKA Tomáš DAMBORSKÝ Jiří KLÁN Petr PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: 2020, DOI

• Machine Learning in Enzyme Engineering

  MAZURENKO Stanislav PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2020, ročník: 10, vydání: 2, DOI

• Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family

  MAREK Martin CHALOUPKOVÁ Radka PRUDNIKOVA Tanyana SATO Yukari REZACOVA Pavlina NAGATA Yuji SMATANOVA KUTA Ivana DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: December 2020, DOI

• Structures of hyperstable ancestral haloalkane dehalogenases show restricted conformational dynamics

  BABKOVÁ Petra DUNAJOVÁ Zuzana CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: 2020, DOI