Informace o projektu
Studium proteinu z patogenu zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu
- Kód projektu
- GA13-25401S
- Období řešení
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Sacharidy jsou v živote nepostradatelné a krome jejich klasické role jako strukturních a energii uchovávajících látek, hrají
klícovou úlohu v mnoha rozpoznávacích signalizacních ci komunikacních procesech. Interakce mezi proteiny a sacharidy se
významne uplatnují pri virových a bakteriálních infekcích, ci v nádorových metastázích. Projekt je primárne zameren na lektiny
a adheziny z bakteriálních patogenu a vláknitých plísní prenášených vzduchem a jejich interakce s lidskými olidosacharidovými
epitopy prítomnými v dýchacích cestách.
Navrhujeme multidisciplinární prístup studia interakcí mezi proteiny a sacharidy, smerující k prevenci adheze patogenu k hostitelským tkáním. Kombinace pokrocilých strukturne funkcních metod umožní provedení racionálního návrhu glykomimetik,
které by mohly inhibovat prichycení patogenu k povrchu bunek a tím pádem být slibnými ligandy predevším pro patogeny
resistentní ke klasické lécbe antibiotiky.
Publikace
Počet publikací: 44
2015
-
High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications
Journal of Cheminformatics, rok: 2015, ročník: 7, vydání: DEC, DOI
-
One point mutation can overturn sugar-binding specificity of lectin RS-IIL from plant pathogen Ralstonia solanacearum
Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty
-
Photorhabdus asymbiotica lectins: structure and function of putative virulence factors
Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty
-
Structural insights into Aspergillus fumigatus lectin specificity: AFL binding sites are functionally non-equivalent
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, rok: 2015, ročník: 71, vydání: March, DOI
-
Structure and specificity of lectin from bacterium Burkholderia pseudomallei
Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty
-
Study of PHL lectin from Photorabdus asymbiotica to revealing its role in pathogenesis
Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty
2014
-
Differences among binding sites of AAL family lectins - High affinity vs. high specificity of sugar binding
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
Engineering the Pseudomonas aeruginosa II lectin: designing mutants with changed affinity and specificity
Journal of Computer-Aided Molecular Design, rok: 2014, ročník: 28, vydání: 9, DOI
-
Enhanced conformational sampling of carbohydrates by Hamiltonian replica-exchange simulation
Glycobiology, rok: 2014, ročník: 24, vydání: 1, DOI
-
Mutagenéza lektínu AFL ako nástroj pre štúdium komplexných interakcií lektín-sacharid
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty