Informace o projektu
Dynamika proteomu v odpovědi na zvýšené hladiny cytokininů u Arabidopsis
- Kód projektu
- IAA600040701
- Období řešení
- 1/2007 - 12/2010
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- cytokininy, proteom, fosforylace proteinů, Arabidopsis, systém genové exprese indukovatelný dexametazonem, 2-D elektroforéza proteinů, MALDI-TOF/TOF MS
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
- Odpovědná osoba Ing. Janette Bobálová, CSc.
Cytokininy (CK) se podílejí, v interakci s dalšími rostlinnými hormony, na regulaci řady vývojových procesů u rostlin. Přesné molekulární mechanizmy působení CK v regulaci vývoje rostlin jsou v současnosti předmětem intenzivního výzkumu. Zatímco analýza profilů exprese genomu v průběhu působení CK byla již započata jinými skupinami, zde navrhujeme analyzovat dynamiku proteomu v odpovědi na zvýšení hladin CK u Arabidopsis za podmínek podobných těm, které byly použity dříve při sledování změn v genové expresi na úrovni celého genomu. To nám umožní provést první srovnání údajů popisujících transkriptom a proteom u vysoce podobných vzorků. Zvýšení hladin CK bude dosaženo působením exogenních CK a využitím nového systému genové exprese indukovatelné dexametazonem - pOp/LhGR. Lze očekávat, že přímé srovnání účinků tří odlišných tříd CK přispěje k objasnění jejich individuálních funkcí v regulaci vývoje rostlin.
Publikace
Počet publikací: 18
2012
-
Rapid and efficient protein enzymatic digestion: An experimental comparison
Electrophoresis, rok: 2012, ročník: 33, vydání: 2
2011
-
Accelerated enzymatic digestion for the analysis of plant proteins
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Comparative evaluation of fast protein enzymatic digestion
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Early cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis thaliana identified by proteome and phosphoproteome profiling
Journal of Experimental Botany, rok: 2011, ročník: 62, vydání: 3
-
Rychlé a účinné enzymatické štěpení proteinů
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
The simultaneous determination of different posttranslational modifications of proteins – A comparison of approaches
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
2010
-
Effect of decreased light intensity on Arabidopsis responsiveness to increased levels of endogenous cytokinins - a proteomic analysis
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Fast and efficient protein enzymatic digestion in proteomics
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Identification of plant proteins by the combination of electromigration techniques and MS
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Novel links between temperature, calcium and cytokinin signaling identified by proteome- and phosphoproteome-wide profiling in Arabidopsis.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty