Project information
Strukturní a funkční komponenty rostlinných telomer
- Project Identification
- GA13-06943S
- Project Period
- 3/2013 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Institute of Biophysics
- Responsible person Mgr. Eva Sýkorová, CSc.
Telomery jsou nukleoproteinové struktury na koncích eukaryotických chromosomů, které jsou udržovány aktivitou komplexu telomerázy. Předkládaný projekt v sobě zahrnuje komplexní studie (1) proteinové struktury a interakcí rostlinných telomer, (2) regulace komplexu telomerázy a (3) evoluce struktury genu TERT kódujícího proteinovou podjednotku telomerázy. Proteiny účastnící se tvorby funkčního
komplexu rostlinné telomery budou identifikovány kombinací vysokokapacitních proteomických přístupů s využitím modelových rostlin s různou délkou telomer – Nicotiana tabacum a Arabidopsis thaliana. Kandidátní proteiny budou následně charakterizovány pomocí T-DNA inzerčních linií A. thaliana a jejich interakce (DNA-protein, protein-protein) s komponenty telomer budou zkoumány pomocí klasických molekulárně-biologických in vitro metod. Studie evoluce struktury telomerázového genu bude rozšířena o polyploidní druhy z rodu Nicotiana a čeledi Solanaceae. Očekávané výstupy projektu přispějí k detailnímu pochopení způsobů a regulace udržování telomer.
Publications
Total number of publications: 10
2017
-
Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo
Protoplasma, year: 2017, volume: 254, edition: 4, DOI
-
Tissue-specific expression of telomerase reverse transcriptase gene variants in Nicotiana tabacum
Planta, year: 2017, volume: 245, edition: 3, DOI
2016
-
Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell
Frontiers in Plant Science, year: 2016, volume: 7, edition: June, DOI
-
Telomere binding protein TRB1 is associated with promoters of translation machinery genes in vivo
Plant Molecular Biology, year: 2016, volume: 90, edition: 1-2, DOI
2015
-
cDNA Library Screening Identifies Protein Interactors Potentially Involved in Non-Telomeric Roles of Arabidopsis Telomerase
Frontiers in Plant Science, year: 2015, volume: 6, edition: November, DOI
-
Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea
Plant Journal, year: 2015, volume: 84, edition: 6, DOI
-
Holokinetic centromeres and efficient telomere healing enable rapid karyotype evolution
Chromosoma, year: 2015, volume: 124, edition: 4, DOI
-
Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes
The Plant Journal, year: 2015, volume: 83, edition: 1, DOI
-
Terminal Restriction Fragments (TRF) Method to Analyze Telomere Lengths
Bio-protocol, year: 2015, volume: 5, edition: 23, DOI
2014
-
Telomere repeat binding proteins are functional components of Arabidopsis telomeres and interact with telomerase
The Plant Journal, year: 2014, volume: 77, edition: 5, DOI